Gene expression profiles of ERG11, MDR1 and AFR1 in Cryptococcus neoformans var.grubbi from HIV patients / Perfiles de expresión de los genes ERG11, MDR1 y AFR1 en Cryptococcus neoformans var. grubii aislados de pacientes con VIH

Introduction: Fluconazole is the most used antifungal drug for prevention and treatment of Cryptococcus spp. infections, the etiological agent of cryptococcosis. Resistance to fluconazole among Cryptococcus neoformans isolates can lead to treatment failure and generate relapses. Objective: To evaluate the expression profiles of the AFR1, MDR1 and ERG11 genes in C. neoformans var. grubii clinical isolates during the in vitro response to fluconazole induction. Materials and methods: Fourteen C. neoformans var. grubii isolates recovered from HIV patients were studied, in which 6 showed sensitivities to fluconazole and 8 decreased sensitivity. The expression levels of ERG11, AFR1 and MDR1 genes were determined by real-time PCR from extracted mRNA. Results: AFR1 and MDR1 genes from C. neoformans var. grubii were overexpressed in fluconazole resistant isolates, whereas ERG11 maintains homogeneous expression in all the evaluated resistance phenotypes of C. neoformans var. grubii isolates. Conclusions: The overexpression of AFR1 and MDR1 genes, which codify for efflux pumps, contributes to fluconazole resistance in the studied isolates. However, the resistance patterns in this fungus and the relapse cases in HIV patients cannot be attributed solely to the exposure to the drug. Heteroresistance and the emerging resistance (resistance through other ERG genes), might be other mechanisms involved in this phenomenon, which must be studied in these isolations.

Introducción. El fluconazol es el antifúngico más utilizado para la prevención y el tratamiento de infecciones causadas por el género Cryptococcus, agente etiológico de la criptococosis. La resistencia al fluconazol en los aislamientos de Cryptoccocus neoformans puede hacer fracasar el tratamiento y generar recaídas de la infección. Objetivo. Evaluar los perfiles de expresión de los genes AFR1, MDR1 y ERG11 en aislamientos clínicos de C. neoformans var. grubii, durante la respuesta in vitro a la inducción con fluconazol. Materiales y métodos. Se estudiaron 14 aislamientos de C. neoformans var. grubii provenientes de pacientes con HIV, de los cuales 6 eran sensibles al fluconazol y 8 presentaban sensibilidad disminuida. Los niveles de expresión de los genes ERG11, AFR1 y MDR1 se determinaron mediante PCR en tiempo real. Resultados. Los aislamientos resistentes al fluconazol mostraron sobreexpresión de los genes AFR1 y MDR1, mientras que la expresión de los fenotipos de resistencia evaluados se mantuvo homogénea en ERG11, en todos los aislamientos de C. neoformans var. grubii. Conclusiones. La sobreexpresión de los genes AFR1 y MDR1 que codifican las bombas de eflujo, contribuye a la resistencia al fluconazol en los aislamientos estudiados. Sin embargo, los patrones de resistencia que se registran en este hongo, sumado a los casos de recaídas en pacientes con HIV, no pueden atribuirse únicamente a los casos de resistencia por exposición al fármaco. Otros mecanismos podrían también estar involucrados en este fenómeno, como la resistencia emergente (resistencia mediante otros genes ERG) y la heterorresistencia, los cuales deben ser estudiados en estos aislamientos.

Perfiles de expresión de los genes ERG11, MDR1 y AFR1 en Cryptococcus neoformans var. grubii aislados de pacientes con HIV / Gene expression profiles of ERG11, MDR1 y AFR1 in Cryptococcus neoformans var. grubbi isolated from HIV patients

Introducción. El fluconazol es el antifúngico más utilizado para la prevención y el tratamiento de infecciones causadas por el género Cryptococcus, agente etiológico de la criptococosis. La resistencia al fluconazol en los aislamientos de Cryptoccocus neoformans puede hacer fracasar el tratamiento y generar recaídas de la infección. Objetivo. Evaluar los perfiles de expresión de los genes AFR1, MDR1 y ERG11 en aislamientos clínicos de C. neoformans var. grubii, durante la respuesta in vitro a la inducción con fluconazol. Materiales y métodos. Se estudiaron 14 aislamientos de C. neoformans var. grubii provenientes de pacientes con HIV, de los cuales 6 eran sensibles al fluconaol y 8 presentaban sensibilidad disminuida. Los niveles de expresión de los genes ERG11, AFR1 y MDR1 se determinaron mediante PCR en tiempo real. Resultados. Los aislamientos resistentes al fluconazol mostraron sobreexpresión de los genes AFR1 y MDR1, mientras que la expresión de los fenotipos de resistencia evaluados se mantuvo homogénea en ERG11, en todos los aislamientos de C. neoformans var. grubii. Conclusiones. La sobreexpresión de los genes AFR1 y MDR1 que codifican las bombas de eflujo, contribuye a la resistencia al fluconazol en los aislamientos estudiados. Sin embargo, los patrones de resistencia que se registran en este hongo, sumado a los casos de recaídas en pacientes con HIV, no pueden atribuirse únicamente a los casos de resistencia por exposición al fármaco. Otros mecanismos podrían también estar involucrados en este fenómeno, como la resistencia emergente (resistencia mediante otros genes ERG) y la heterorresistencia, los cuales deben ser estudiados en estos aislamientos.

Introduction: Fluconazole is the most used antifungal drug for prevention and treatment of Cryptococcus spp. infections, the etiological agent of cryptococcosis. Resistance to fluconazole among Cryptococcus neoformans isolates can lead to treatment failure and generate relapses. Objective: To evaluate the expression profles of the AFR1, MDR1 and ERG11 genes in C. neoformans var. grubii clinical isolates during the in vitro response to fluconazole induction. Materials and methods: Fourteen C. neoformans var. grubii isolates recovered from HIV patients were studied, in which 6 showed sensitivities to fluconazole and 8 decreased sensitivity. The expression levels of ERG11, AFR1 and MDR1 genes were determined by real-time PCR from extracted mRNA. Results: AFR1 and MDR1 genes from C. neoformans var. grubii were overexpressed in fluconazole resistant isolates, whereas ERG11 maintains homogeneous expression in all the evaluated resistance phenotypes of C. neoformans var. grubii isolates. Conclusions: The overexpression of AFR1 and MDR1 genes, which codify for efflux pumps, contributes to fluconazole resistance in the studied isolates. However, the resistance patterns in this fungus and the relapse cases in HIV patients cannot be attributed solely to the exposure to the drug. Heteroresistance and the emerging resistance (resistance through other ERG genes), might be other mechanisms involved in this phenomenon, which must be studied in these isolations.

Whole-Genome Sequencing of Neisseria gonorrhoeae Isolates with Antimicrobial Resistance Plasmids from a Homeless Community in Colombia.

Neisseria gonorrhoeae is a pathogenic bacterium causing sexually transmitted infections, and it is associated with high antibiotic resistance rates. Here, we describe the genome sequences of four isolates from a homeless community in Colombia.

Caracterización de Candida spp. aisladas a partir de urocultivos en la ciudad de Medellín / Characterization of Candida spp isolated from urine cultures of Medellín

Resumen Candida spp. es un agente etiológico importante en infecciones del tracto urinario, principalmente en población con terapia antimicótica de amplio espectro y con catéteres urinarios. Candida albicans es la especie más frecuente, pero otras especies han surgido como patógenos emergentes. En este trabajo se recolectaron aislamientos de Candida spp. de urocultivos de pacientes que consultaron en Dinamica IPS entre enero 2016 y noviembre 2017. Para estimar la frecuencia de las especies y observar los patrones de sensibilidad, se realizó la identificación fenotípica y su perfil de sensibilidad con el sistema comercial Vitek 2® (BioMérieux, Inc.), adicionalmente se evaluaron mediante análisis de las secuencia y filogenética ITS1-5.8S-ITS2. En el estudio se incluyeron 78 aislamientos de Candida spp. Las frecuencias de especies de Candida identificadas empleando las herramientas moleculares fueron: C. albicans (38,5%), C. tropicalis (23,1%), C. glabrata (21,8%), C. parapsilosis (10,3%), C. metapsilosis y C. krusei (2,5%) y C. guillermondi (1,3%). La identificación por métodos moleculares y por el sistema Vitek 2 fue: C. albicans (93,3%), C. glabrata (94,1%), C. tropicalis (83,3%), C. parapsilosis (75%) C. guilliermondii y C. krusei (100%). La sensibilidad de todos los aislamientos al fluconazol fue 93,6%.

Abstract Candida spp is an important etiologic agent in urinary tract infections, mainly in patients in broad-spectrum antifungal therapy, with urinary catheters. Candida albicans is the most frequent specie; but other species have arised as emerging pathogens. In this study, isolates of Candida spp. of urine cultures from patients who consulted in Dinamica IPS between January 2016 and November 2017 were evaluated. To estimate the frequency of the species and to observe the sensitivity patterns, the phenotypic identification and its sensitivity profile was performed employed the Vitek 2® commercial system. (BioMérieux, Inc) In addition the isolates were evaluated by sequence analysis and phylogenetics ITS1-5.8S-ITS2. This study included 78 isolates of Candida spp. The frequencies of Candida species identified using the molecular tools were: C. albicans (38.5%), C. tropicalis (23.1%), C. glabrata (21.8%), C. parapsilosis (10.3%), C. guillermondi (1.3%) and C. metapsilosis and C. krusei (2.5%). The identification by molecular methods and by Vitek 2 system were: C. albicans (93.3%), for C. glabrata (94.1%), C. tropicalis (83.3%), C. parapsilosis (75%) and 100% for C. guilliermondii and C. krusei.. fluconazole sensitivity of all isolates was 93.6%

A novel Sporothrix brasiliensis genomic variant in Midwestern Brazil: evidence for an older and wider sporotrichosis epidemic.

Sporotrichosis is a subcutaneous infection caused by fungi from the genus Sporothrix. It is transmitted by inoculation of infective particles found in plant-contaminated material or diseased animals, characterizing the classic sapronotic and emerging zoonotic transmission, respectively. Since 1998, southeastern Brazil has experienced a zoonotic sporotrichosis epidemic caused by S. brasiliensis, centred in the state of Rio de Janeiro. Our observation of feline sporotrichosis cases in Brasília (Midwestern Brazil), around 900 km away from Rio de Janeiro, led us to question whether the epidemic caused by S. brasiliensis has spread from the epicentre in Rio de Janeiro, emerged independently in the two locations, or if the disease has been present and unrecognized in Midwestern Brazil. A retrospective analysis of 91 human and 4 animal cases from Brasília, ranging from 1993 to 2018, suggests the occurrence of both sapronotic and zoonotic transmission. Molecular typing of the calmodulin locus identified S. schenckii as the agent in two animals and all seven human patients from which we were able to recover clinical isolates. In two other animals, the disease was caused by S. brasiliensis. Whole-genome sequence typing of seven Sporothrix spp. strains from Brasília and Rio de Janeiro suggests that S. brasiliensis isolates from Brasília are genetically distinct from those obtained at the epicentre of the outbreak in Rio de Janeiro, both in phylogenomic and population genomic analyses. The two S. brasiliensis populations seem to have separated between 2.2 and 3.1 million years ago, indicating independent outbreaks or that the zoonotic S. brasiliensis outbreak might have started earlier and be more widespread in South America than previously recognized.

Semiotécnicas aplicadas en la práctica odontológica. Investigación documental / Semi-techniques applied in dental practice. Documentary research

La presente investigación documental denominada "Semiotécnicas aplicadas en la práctica odontológica" tiene como finalidad revisar las técnicas semiológicas que pueden ser aplicadas en la profesión odontológica, así también dar a conocer algunos aspectos como el ético, social, cultural, etc., que entran en juego en la relación odontólogo-paciente; de igual manera se estudiaron algunos exámenes complementarios como por ejemplo: exámenes de laboratorio y técnicas radiográficas, que contribuyen a realizar un diagnóstico certero. Para llevar a cabo esta investigación documental se recopilo información sobre el tema consultando libros, revistas, páginas de Internet, folletos, etc.; y reclasificando la información de acuerdo al tema en estudio. Concluyendo las semiotécnicas que se aplican en la práctica odontológica deben ser siempre complementadas con una adecuada anamnesis y exámenes de laboratorio y radiográficos complementarios para realizar un buen diagnóstico y dar un tratamiento integral al paciente.

The present documentary research called "Semiotechnics applied in dental practice" aims to review the semiological techniques that can be applied in the dental profession, as well as to make known some aspects such as ethical, social, cultural, etc., that enter into play in the dentist-patient relationship; in the same way, some complementary tests were studied, such as: laboratory tests and radiographic techniques, which contribute to making an accurate diagnosis. To carry out this documentary research, information on the subject was collected by consulting books, magazines, Internet pages, brochures, etc .; and reclassifying the information according to the subject under study. Concluding the semi-techniques that are applied in dental practice, they must always be complemented with an adequate anamnesis and complementary laboratory and radiographic examinations to make a good diagnosis and give a comprehensive treatment to the patient.